近年來，我國農業源污染排放已占到污染總排放量的，環保部表示我國“十三五”期間全國將新增完成13萬個建制村環境綜合整治。
隨著我國經濟的不斷發展，工業化和城鎮化進程速度加快，我國經濟增長與環境污染的矛盾逐漸加深，目前，環境污染已成為危害人民健康的重大因素，“十三五”期間，環保治理將成為國家重點關注的問題。
造成環境的污染因素較多，而農業污染源污染排放已占到污染總排放量一半的份額，農村環境治理任務繁重，但也是國家必須重點關注的工作。目前我國九成以上農村環境基本處于無人管理的狀態，農業污染未收到重視，也是目前農業污染問題頻發的原因之一。
近年來，農村環境的治理工作逐漸受到重視，據數據顯示，到2014年底，全國已有5.9萬個村莊已開展環境綜合整治，到2015年底，要完成7萬個建制村的環境整治任務，“十三五”期間全國新增完成13萬個建制村環境綜合整治。
同時，針對一些地方建成項目缺乏管理，治污效果難以持續的問題，環保部將建立農村環境治理長效管護機制，同時探索財政資金政策與金融、價格、產業等政策手段形成合力，共同促進環境治理保護。
從長期來看，農村環境治理工作要形成一個長效運行機制，將農村污染源如污水，垃圾，畜禽糞便這些來整線統籌來考慮，這樣才能將農村環境治理工作得到長期有效的進行。
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