乳酸菌是無芽孢、革蘭氏染色陽性細菌，能利用可發酵碳水化合物產生大量乳酸，在自然界分布極其廣泛，物種多樣性豐富。乳酸菌通常存在于蔬菜、肉制品、乳制品等食品和禽類、畜類腸道或口腔中，是構成正常微生物菌群的重要成員。
乳酸菌具有調節腸道正常菌群、抑制腸道內腐敗菌生長、維持腸道健康、提高食物消化率、提高免疫力、提高生物效價、促進動/植物生長、促進營養吸收、降低血清膽固醇、去除角質、抑制黑色素、舒緩壓力/焦慮等情緒等功能，被廣泛應用在農業、食品、畜牧業、醫藥、美容等多個領域，且具有極高的學術價值，是研究生物遺傳、生化、基因工程、分子生物學的理想材料。
據新思界產業研究中心發布的
《2023-2028年中國乳酸菌行業市場深度調研及發展前景預測報告》顯示，食品是乳酸菌的最大應用領域，乳酸菌飲品占比最大。隨著乳酸菌促進腸胃蠕動、維持腸道健康等概念的提出和流行，乳酸菌飲品應運而生，成為消費熱潮，深受大眾喜愛。我國乳酸菌飲品分為常溫乳酸菌飲品和低溫乳酸菌飲品。常溫乳酸菌飲品對保存環境要求較低，近五年來發展迅速，鋪貨速度快，市場滲透率高；低溫乳酸菌飲品對貯藏環境和運輸條件要求苛刻，隨著近年我國冷鏈物流行業的快速發展，低溫乳酸菌飲品市場潛力較大。
乳酸菌飲品中，添加了乳酸菌的發酵乳制品發展最為迅速。我國是乳制品生產和消費大國，乳制品市場規模增長迅速，其中，發酵乳制品銷量增長較快，已成為乳制品產業的重要組成部分。在此背景下，乳酸菌發酵乳制品市場前景廣闊，利好乳酸菌行業發展。
醫藥是乳酸菌的另一重要應用領域。我國建立了乳酸菌精準篩選模型及可視化平臺，目前已經篩選出包括鼠李糖乳桿菌、乳雙歧桿菌、植物乳桿菌、干酪乳桿菌在內的數十種具有提高免疫力、促進腸道健康、降低血清膽固醇等多種功能的乳酸菌，并投入改善高尿酸癥、骨質疏松、壓力及焦慮、高血脂、冠心病、糖尿病、過敏、腸易激綜合征、慢性腎臟病等多項臨床研究中。
新思界
產業分析人士表示，乳酸菌菌種是乳酸菌產業發展的核心，我國乳酸菌產業起步較晚，目前，生產乳酸菌產品的菌種及其制劑主要被歐美發達國家壟斷，本土創新能力亟待提高。為提高我國乳酸菌資源的開發利用水平，2019年，我國內蒙古自治區啟動了“萬株乳酸菌基因組計劃”，將打造世界上最大的乳酸菌基因數據庫，有望推動我國乳酸菌產業進一步發展。
