傅里葉質譜儀是用于化學、生物學等領域的分析儀器，可以應用在有機物分子量、生物大分子、蛋白質組學、蛋白鑒定、蛋白表達、蛋白定量、生物標記、翻譯后修飾、藥物代謝、代謝物鑒定、代謝物定量等研究分析方面。傅里葉離子回旋共振質譜儀具有高分辨率優勢，傅里葉變換離子回旋共振質譜儀（FTICR-MS）是前者與計算機技術相結合的產物，也稱為傅里葉變換質譜儀。
傅里葉變換質譜儀，是根據給定磁場中的離子回旋頻率來測量離子質荷比的質譜分析儀。傅里葉變換質譜儀的工作原理是：離子在強磁場作用下以很小的軌道半徑作圓周運動，此時離子的回旋頻率與離子質量成反比，不產生可接收電流信號；施加電壓，當強磁場頻率與離子回旋頻率相同時會產生共振現象，離子吸收射頻能量，運動軌道半徑增大，從而產生可被接收的電流信號。
自20世紀70年代中期傅里葉變換質譜儀問世以來，憑借優良性能，其應用市場得到迅速發展。傅里葉變換質譜儀具有分辨率高、靈敏度好、檢測準確度高、數據采集速度快、可利用不同電離源、可進行多級質譜檢測、定性能力極好等優點，在化學、生物學等高端科研領域具有重要作用，特別是在生物大分子、蛋白組學、代謝組學研究方面具有不可或缺性。
新思界
行業分析人士表示，傅里葉變換質譜儀功能強大，但儀器體積大、質量重，且產品價格高昂，維護費用昂貴，因此主要應用在高端科研領域，市場普及率有限。由于技術含量高，全球傅里葉變換質譜儀生產企業數量較少，領先企業主要集中在歐美地區。一直以來，我國儀器儀表行業高端市場競爭力不足，需求對外依賴度大，目前來看，我國質譜儀企業在傅里葉變換質譜儀研制領域核心技術掌握有限，未來還有較大進步空間。
