RNA探針，是生物探針的一種，屬于核酸探針，是能與相對應核酸序列進行互補結合的一段核酸分子，根據(jù)來源來看，主要包括單鏈cDNA探針、cRNA探針、寡核苷酸探針三種。
RNA探針的核酸分子為單鏈，需經(jīng)過示蹤物標記，然后與靶核酸序列進行雜交，形成雙鏈，對標記物進行探測，可獲得樣品中是否含有目標核酸序列，以及含量的多少與位置。RNA探針核酸分子的選擇需要關注核酸分子的特異性、制備與標記難易程度、雜交穩(wěn)定性等，早期采用的RNA探針主要是細胞mRNA探針、病毒RNA探針，標記難度較大，應用受到限制。
根據(jù)新思界產(chǎn)業(yè)研究中心發(fā)布的
《2024-2028年RNA探針行業(yè)深度市場調研及投資策略建議報告》顯示，目前常見的RNA探針細分產(chǎn)品中，單鏈cDNA探針，對相應基因進行轉錄，獲得mRNA，再經(jīng)逆轉錄獲得cDNA，制備過程較為復雜；cRNA探針，以cDNA為模板，經(jīng)過體外轉錄獲得cRNA，制備難度較大；寡核苷酸探針，體外人工合成的與目標基因序列互補的單鏈核苷酸片段，對片段長度范圍要求較高，標記物攜帶有限。這些不同類型的RNA探針產(chǎn)品各有優(yōu)缺點。
RNA探針采用示蹤物進行標記，通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、熒光染料等，這些示蹤物具有自顯影或者發(fā)光效果，以達到高靈敏檢測效果。例如以地高辛標記的RNA探針為例，可以利用瓊脂糖凝膠電泳檢測片段長度，利用斑點雜交實驗驗證探針靈敏度，雜交完成后標記物檢測方便。
與DNA探針相比，RNA探針具有可改良雜交印跡、雜交反應效率高的優(yōu)點，但僅能夠在體外轉錄過程中進行標記，且不穩(wěn)定容易被降解。因此RNA探針一般不應用在檢測領域，主要應用于科研領域。RNA探針可以廣泛應用在動物、植物、微生物、病毒等基因編輯研究領域，例如HIV病毒基因組DNA克隆研究方面。
新思界
行業(yè)分析人士表示，在全球范圍內，RNA探針提供商主要有瑞士Roche、荷蘭Biolegio、英國Bioline、美國Sigma-Aldrich、美國Empire Genomics、美國Bio-Techne、美國Promega、中國臺灣Abnova Corporation等，主要集中在美國地區(qū)，其次是歐洲地區(qū)。
我國科研實力不斷進步，RNA探針作為重要工具，研究還在不斷深入。2024年3月，中國科學院大連化學物理研究所研究團隊，發(fā)展了能夠與RNA特異性可逆結合，在活細胞內對細胞核核仁穩(wěn)定成像的“緩沖熒光探針”Nu-AN，實現(xiàn)了對核仁動態(tài)輪廓的成像。
