cRNA探針，是以cDNA為模板，通過體外轉錄獲得cRNA制備而成的一種單鏈探針，是一種核酸探針，屬于RNA探針。
cRNA探針的制備過程是，從組織或細胞中提取mRNA，經逆轉錄作用獲得cDNA，對cDNA進行克隆并連接到載體上，以克隆的cDNA為模板，以含有標記物的核苷酸為原料，進行體外轉錄產生cRNA。在此過程中，cRNA的轉錄方向可以控制，能夠獲得帶有標記物的與mRNA同序列的同義cRNA探針，或者與mRNA互補的反義cRNA探針。
cRNA探針的工作原理是，利用cRNA探針與樣品核酸分子進行雜交，若樣品中含有與cRNA探針互補的核酸序列（即目標核酸序列），則二者相互作用通過氫鍵緊密相連形成雙鏈，洗去未雜交的多余cRNA探針，基于標記物的自顯影或者發光作用對樣品進行檢測，獲得目標核酸序列相關信息，即利用與cRNA探針檢測出與之互補的核酸序列。
采用cRNA探針雜交形成的雙鏈穩定性高，不會受RNA酶影響，而cRNA探針本身對RNA酶敏感，會被破壞，因此可以利用RNA酶來清除未雜交的多余cRNA探針，以排除干擾，便于后續對樣品進行探測觀察。
cRNA探針可應用范圍廣泛，包括檢測同種基因在不同條件下的表達水平、協助注釋未知基因組區域、研究基因組復制機制、檢測病毒的存在以及含量等。例如，利用地高辛標記的cRNA探針，在胰腺切片上進行原位雜交，可用來檢測胰島素基因表達產物mRNA，結果可靠性高。但cRNA探針制備過程較為復雜，對實驗設備、試驗環境、實驗人員技術要求較高。
新思界
行業分析人士表示，與歐美國家相比，我國基因研究起步較晚，但發展迅速，部分技術已經達到或接近國際先進水平。同時，為實現疾病早發現、早治療以及精準治療，我國基因測序行業迅速崛起，特別是高通量測序（NGS）發展速度快，倒推基因研究技術不斷進步。在此背景下，我國市場對核酸探針需求不斷增長，cRNA探針作為核酸探針的一種，未來市場前景良好。
