人工合成寡核苷酸探針，是以核苷酸為原料，利用DNA合成儀，人工合成的生物探針，屬于核酸探針的一種。從細胞中提取出來的DNA片段，存在高度重復的序列，人工合成寡核苷酸探針根據目的基因設計，避免了這一缺點。
人工合成寡核苷酸探針經過示蹤物標記，與樣品中核酸分子進行雜交，當樣品中存在與其互補的核酸序列，二者相連形成雙鏈，之后未雜交探針被洗去，通過探針標記物的自顯影、發光效果，對人工合成寡核苷酸探針進行檢測，進而測定樣品中是否含有與人工合成寡核苷酸探針互補的核酸序列。
人工合成寡核苷酸探針可以識別目的基因序列中一個堿基的變化，即通過雜交來識別單個堿基突變、單個堿基錯配情況；人工合成寡核苷酸探針可以利用酶、熒光染料進行標記；人工合成寡核苷酸探針一次合成可得到大量產品，成本較低。
但人工合成寡核苷酸探針的長度必須適中，太長或者太短都會導致雜交過程出現問題；且由于人工合成寡核苷酸探針片段較短，攜帶的標記物較少，又采用的是非放射性同位素標記，敏感度有限；此外人工合成寡核苷酸探針與mRNA雜交形成的雙鏈，穩定性低于cRNA探針與mRNA形成的雙鏈。
核酸探針細分產品主要包括DNA探針、cDNA探針、cRNA探針、人工合成寡核苷酸探針四種，前三種均為克隆產品，而后一種為人工合成產品，更易于大批量生產，因此在生命科學實驗、生物醫藥原料藥制備等領域應用廣泛。此外，人工合成寡核苷酸探針還可以應用到基因診斷、個體化用藥分析等方面。
新思界
行業分析人士表示，DNA合成儀是自動化合成結構類似DNA或RNA的寡核苷酸的儀器，是人工合成寡核苷酸探針行業的核心上游設備，其設計、研發、生產技術壁壘高。近年來，受生物學、醫學、藥學等行業快速發展，我國市場對DNA合成儀需求快速增長。目前，我國已經具備DNA合成儀生產能力，但產品品質與進口產品相比存在較大差距，對我國人工合成寡核苷酸探針行業發展造成一定不利影響。
